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酵母单杂交技术及其应用
2024.09.10   点击43次

基因表达调控在细胞功能和生物体发育中起着至关重要的作用。蛋白质与DNA序列的特异性结合是基因调控的关键步骤之一。酵母单杂交技术为研究这种蛋白-DNA相互作用提供了一个简便而有效的工具。通过酵母单杂交库构建,研究人员可以系统地筛选和鉴定与特定DNA序列相结合的转录因子。

 

酵母单杂交技术基于酵母细胞中的报告基因激活。酵母单杂交系统通常包括两个基本组件:

 

1. DNA诱饵序列:目标DNA序列被克隆到含有报告基因的载体中,该载体通常带有一个最小启动子和一个缺乏激活结构域的报告基因(如HIS3、lacZ)。当特异性结合蛋白与DNA诱饵序列结合时,它会促进报告基因的表达。

2. 蛋白质库:目标蛋白质(转录因子)与激活结构域融合并表达在酵母细胞中。当这些融合蛋白与DNA诱饵序列结合时,它们通过激活结构域启动报告基因的转录。

通过这种方式,可以筛选出与特定DNA序列结合的蛋白质。

 

酵母单杂交库构建

 

酵母单杂交库构建是酵母单杂交实验的关键步骤。酵母单杂交库构建的质量直接影响筛选结果的有效性和可靠性。为了全面识别与目标DNA序列结合的转录因子,酵母单杂交库构建通常涵盖多种组织或细胞类型的cDNA,以最大限度地捕获不同的转录因子。

 

酵母文库构建的方法

 

1. 提取mRNA:从感兴趣的组织或细胞中提取mRNA,并通过逆转录生成cDNA。这些cDNA将作为后续实验的模板。

2. cDNA克隆:将生成的cDNA克隆到表达载体中,这些载体通常带有GAL4激活结构域(AD),用于与酵母单杂交系统的诱饵DNA结合。常用的载体如pGADT7可以有效表达融合蛋白。

3. 转化和文库构建:将携带cDNA的载体转化入酵母细胞中,生成酵母文库。该文库表达大量不同的融合蛋白,用于后续的筛选实验。

 

酵母单杂交文库筛选

 

筛选步骤

 

1. 共转化:将含有目标DNA诱饵序列的报告载体与酵母文库共同转化入酵母细胞中。

2. 选择性培养:在缺少特定氨基酸或含有药物筛选剂的培养基上培养转化后的酵母细胞。与DNA诱饵序列结合的蛋白质将激活报告基因,使酵母在选择性条件下生长。

3. 阳性克隆鉴定:通过PCR、测序或其他分子生物学方法鉴定阳性克隆中的结合蛋白,从而识别潜在的转录因子。

 

筛选结果的验证

 

- 重新转化验证:将筛选出的阳性克隆重新转化入含有诱饵序列的酵母细胞中,以确认结合的特异性和可重复性。

- 体外结合实验:使用电泳迁移率变动实验(EMSA)或染色质免疫沉淀(ChIP)实验验证蛋白质-DNA相互作用。

- 功能分析:通过基因敲除、过表达或点突变分析验证相互作用蛋白在调控中的具体功能。

 

酵母单杂交技术的应用

 

- 基因调控研究:通过酵母单杂交库筛选,研究人员可以识别调控特定基因表达的转录因子,从而揭示基因调控机制。

- 转录因子识别:酵母单杂交技术有助于识别未知功能的转录因子及其目标DNA序列,扩展了我们对转录因子家族的认识。

- 疾病相关基因研究:酵母单杂交技术用于研究与疾病相关的DNA序列,如癌症或遗传病,帮助揭示潜在的致病机制。

 

酵母单杂交技术通过结合酵母单杂交库构建和筛选,为研究蛋白质-DNA相互作用提供了一种有效的工具。该技术在基因调控、转录因子识别及疾病研究中具有广泛的应用前景。未来,随着技术的进步,酵母单杂交将在探索基因表达调控机制中发挥更为重要的作用。

 

参考文献 

1. Wang, H., Wang, Z., & Wang, Y. (2011). The yeast one-hybrid system: An effective method for screening gene transcription factors. Nature Protocols, 6(6), 768-775.

2. Reece-Hoyes, J. S., & Marian Walhout, A. J. (2012). Yeast one-hybrid assays: A tool to dissect protein-DNA interactions. Methods in Molecular Biology, 812, 189-208.

3. Deplancke, B., Dupuy, D., Vidal, M., & Walhout, A. J. M. (2004). A Gateway-Compatible Yeast One-Hybrid System. Genome Research, 14(10b), 2093-2101.

4. Li, H., & Herskowitz, I. (1993). Isolation of the ORC6, a component of the yeast origin recognition complex by a one-hybrid system. Science, 262(5135), 1870-1874.

5. Bruckner, A., & Lehming, N. (2003). Yeast One- and Two-Hybrid Systems for the Analysis of Protein-Protein and Protein-DNA Interactions. Current Genetics, 42(3), 225-235.

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